申請補助數額：1000萬元-1500萬元
（一）扶持區域
項目所在區域必須是農業綜合開發縣，并且農業發展思路清晰、主導產業突出、新型農業經營主體發育良好、循環模式相對成熟。基本條件如下：
1.縣（市）級人民政府對生態循環農業發展高度重視，已制定生態循環農業發展規劃或畜禽糞便、秸稈等農業廢棄物綜合利用、稻漁生態種養等相關規劃；
2.縣（市）級人民政府建立了推進生態循環農業發展的組織協調機制，開展過生態循環農業管理制度創新與探索；
3.對農牧漁業大縣，以及列入國家現代農業示范區、國家農業綜合改革試驗區、國家可持續發展試驗示范區的縣市及開展農業廢棄物資源化利用試點、種養循環果菜茶有機肥替代化肥行動的縣市給予優先扶持，適當向中西部生態保護與建設重點地區傾斜。
（二）申報對象與條件
分為兩類：
1.龍頭企業和農民合作組織
（1）申報方式：申報對象可單獨申報項目或聯合申報項目。
（2）申報條件：申報對象須在工商部門注冊1年以上、具備可持續經營能力；通過信用中國網、中國政府采購網等查詢，沒有不良誠信記錄或被列入監管黑名單；具有專門從事生態環境保護的專業人員和較強的技術力量；須委托專業機構作為技術依托單位，協助開展項目區域生態環境監測和實施綜合養分管理計劃等；項目區域為特定行政區域（至少為1個鄉鎮），邊界清晰，相對集中連片；對于不能完成整鄉鎮推進的項目，要求項目覆蓋農田面積不低于1萬畝，畜禽飼養規模不低于1.5萬頭豬當量。
2.縣鄉人民政府
（1）申報方式：縣鄉政府根據實際情況，提出項目申報方案，明確實施范圍、循環模式、建設主體、建設內容、運營機制、資金測算、資金來源等。
（2）申報條件及有關要求：申報項目的縣鄉政府須委托專業機構作為技術依托單位，協助開展項目區域生態環境監測和實施綜合養分管理計劃等；項目區域為特定行政區域（至少為1個鄉鎮），邊界清晰，相對集中連片；對于不能完成整鄉鎮推進的項目，要求項目覆蓋農田面積不低于1萬畝，畜禽飼養規模不低于1.5萬頭豬當量。縣鄉政府自身未被列入監管黑名單。
縣鄉政府只負責項目申報及項目實施的組織和協調，不能直接參與項目建設和運營管理。
（三）投入規模
單個項目中央財政資金投入控制在1000萬元左右（地方財政資金投入比例高的省份可適當降低中央財政資金投入規模，全部財政資金投入控制在1500萬元左右）。地方財政投入比例及項目單位自籌資金比例原則上按國家農業綜合開發產業化發展項目政策執行。
條件基本具備的省份，每年安排項目不超過3個；條件較好的省份可適當增加項目個數，但最多不超過6個。
項目建設期為1年
